767.锁定
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找到转录信息。基于这一特点，10×GenomicsChromium平台同时测序数千个细胞。与Smart-seq2等低通量方法相比，10×GenomicsChromium平台因其成本低、效率高而被更广泛地应用于B细胞检测。
在对多种scRNA-seq方法的比较研究中，10×Genomics也比其他高通量方法如Drop-seq和Indrops[33]具有更高的灵敏度，更高的与线粒体基因匹配的reads比例，更低的噪声。利用10×Genomics和Smart-seq2平台，可以通过不同的免疫球蛋白重链特征区分CRC中B细胞的亚群，聚类结果无明显差异。但是，10×Genomics也有不足之处，它不能覆盖所有的基因，并且存在3区域偏倚，在检测基因突变或mRNA剪接位点时可能会遗漏一些重要信息。此外，这种方法对细胞质量有更高的要求，不同的组织和不同的获取样本的方法都不同。利用scRNA-seq，我们可以更精确地定义细胞的亚型，追踪它们的发育谱系，确定克隆型和表现型之间的关系，绘制不同细胞之间的相互作用和空间关系图，从而从多个维度描述TME。此外，还需要通过一系列体内和体外实验来验证结果。我们总结了使用scRNA-seq研究的最新出版物
B细胞受体(Bcellreceptor，BCR)是一种能识别并结合特异性抗原的膜免疫球蛋白，在B细胞的分化成熟过程中起着重要作用。BCR由两条重链和两条轻链组成，其中可变(V)、多样性(D)和连接(J)基因序列的重组创造了B细胞的多样性。这种多基因的复杂性使得鉴别不同的受体变得困难。然而，由于每个B细胞通常表达一个单一的受体，潜在的抗原特异性受体可以通过给定的原细胞链发现。BCR的两个主要功能如下。首先，它通过诱导B细胞激活过程中肌动蛋白骨架的实质改变和各种基因的表达来激活B细胞。其次，它介导抗原的鉴定和提取，从而导致加工过的肽在主要组织相容性复合体II(MHCII)上呈现给T辅助细胞。因此，BCR测序有助于进一步了解B细胞分化的轨迹及其特异性识别抗原性的机制，特别是当与单个B细胞的完整转录组身份配对时，这为了解癌症的发展提供了线索。更重要的是，BCR测序可以追踪来自单细胞的群体，揭示克隆型和表型之间的关系。ScRNA-seq技术在BCR测序中具有天然优势，因为含有UMI的微流控系统可以保证同源VH-VL配对的保存，而这些同源VH-VL配对在B细胞批量测序中可能会丢失。BASIC是一个在单细胞分辨率上进行BCR测序的平台。作为重建配对全长BCR序列的工具，BraCeR为B细胞的克隆推断和谱系追踪提供了一个完整的管道。LIBRA-seq是一种高通量的方法，将BCRse-序列与其同源抗原特异性连接起来，可以用来绘制特定对象中数千个B细胞的抗原特异性。
研究免疫球蛋白以探讨体液免疫的复杂性
免疫球蛋白存在于肿瘤和血清中，在肿瘤中起双重作用。抗体通过其片段可结晶(Fc)支配功能，并受翻译后修饰调控。通常，免疫球蛋白是由骨髓和脾脏的浆细胞(PCs)分泌的。组织炎症区域和肿瘤内部的pc，特别是在三级淋巴结构(TLS)中，分泌肿瘤相关抗体并直接在肿瘤上诱导原位效应。在抗肿瘤功能方面，IgG是最重要的一类人免疫球蛋白，因为它能够结合巨噬细胞和自然杀伤细胞上的Fcγ受体，并促进、ADCP和CDC的作用。此外，IgG对抗原处理和呈递至关重要，因为抗原呈递细胞(APCs)上的Fcγ受体可以与IgG包被的免疫复合物结合，激活T细胞。抗体和抗体分泌细胞(APCs)的单细胞测序有助于进一步明确B细胞体液免疫的复杂网络。已经报道了一种单细胞液滴微流控测序方案，用于特异性结合靶细胞的抗体，这也适用于初级人类是一种液滴微流体系统，用于高通量单细胞筛选分泌IgG的原代细胞，一方面，通过基于荧光的液
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